创新体系建设有待破题
新产品、新技术、新工艺、新管理体系的建立对打造兽药企业的核心竞争力至关重要。目前国内兽药企业真正具备创新能力，特别是在新产品研发方面具备创新能力的可谓是寥若晨星。要求国内兽药行业在当前阶段就达到国外自主研发水平是不现实、不可能的，因为国外研发一个新产品，动辄就是十几亿美元的投入，耗费十几年的时间，而国内大部分兽药企业没有能力靠微利积累资本去开展创新。
要谋求发展，国内兽药产业走“跟随”和“模仿”路线是一个可行性战略。但在目前的这种模仿和跟随战略下，国内兽药企业并没有呈现出明显的“创新”能力，其中除去企业自身因素，国家对企业研发支持力度的薄弱也是制约因素之一，当前国家科研经费大多投入到国内科研院所，但研究结果多是以论文形式出现，而不是以产品出现，很多论文研究的产品要真正转化到产业化上来，中间环节还需要大量的投资进行规划。
当前，兽药高端市场的产品大多都是国外企业在占领，就同类产品比较而言，国外企业比国内定价要高出几倍。未来国内兽药市场环境规范后，国外企业就会蜂拥而入，到时国内企业如没有自主创新就无法参与国际竞争，这对国内企业的伤害是非常大的。
未来国内兽药产业的自主创新之路对整个行业而言是亟待破解的大课题。
市场机制建设有待破题
兽药产业在理论上应是市场经济模式，产品应是长期刚性需求趋势，它的价格会随着需求量的变化而对价格产生影响，但当前兽药产业的计划经济色彩仍非常浓厚，很多经济原理在这个市场是不发挥作用的，最简单的价格信息机制不存在。
由于兽药产业主体还是企业本身，市场最大的功能就是配置资源。当前国内的兽药产业还处于发展的初级阶段，兽药产业资源还没有起到市场配置的作用，其市场化程度还远不成熟，众多兽药企业的历史感、危机感，在整体上与其他行业比较起来有不小的差距，具体表现为：一是兽药行业内的利润分配还缺乏有序的机制，二是行业内部恶性竞争严重，假冒伪劣产品现象仍未杜绝。
未来如何完善、发挥市场机制自身的作用，政府需要在哪些政策上进行引导，政府和企业之间如何准确定位各自角色？这将成为提升行业发展水平的关键课题。
信用制度建设有待破题
诚信缺失的问题不仅仅是一个产业的问题，也是中国经济转型期存在的焦点问题。目前的兽药产品质量问题在很大程度上是行业信用制度缺失因素造成的。
在中国传统文化中，诚信是一个做人、做事准则，这也应是当今兽药企业市场行为的一个准则，但现在个别的企业反而缺失了。一方面，由于市场诚信的缺失，非法企业在市场的肆虐给合法企业造成很大的压力；另一方面，由于当前人民币升值，原材料价格上涨，兽药产业也面临着很大压力，部分合法企业的产品质量开始出现问题。当前，政府对兽药市场的整治是下了大的决心，一方面，对市场上的非法造假、销售行为，政府责无旁贷的要严厉打击；另一方面，对合法企业的造假，政府也会逐步加大打击力度。
广大兽药企业主也要认识到，成熟的市场经济是诚信经济，更是信用制度发挥作用的经济；并且，成熟的市场经济是法制经济，不是法办经济，法律是备而不用，管理不是靠处罚达到目的。
兽药业在经历过初级阶段之后，行业在未来必然有诚信、信用制度的建设，必然有品牌的建设，大部分对产品、社会负责任的企业家要树立长远的信心，企业现在的损失，可能为未来的发展换来宝贵的财富。
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