我国兽药行业未来发展趋势与畜牧业发展紧密相关，我国畜产品总产量已经位居世界第一，肉类、禽蛋人均占有量超过世界平均水平，山东省肉、蛋、奶总产量分别位居全国的1、2、4位。我国畜牧业并未走到尽头，一方面农村居民和中西部地区消费潜力尚未体现，另一方面与国外畜牧业发达国家对比，畜牧业产值在农业总产值中的比重还应增加一倍，目前尚未超过种植业产值。同时，也应该看到，人畜争粮和畜牧业污染的问题越来越突出，不考虑产品质量、市场供求和生态平衡，盲目过快发展畜牧业，是不可取的。
兽药在畜牧业发展进程中，有无可代替的作用，在畜牧业发展初期，千方百计防治动物疾病，减少动物死亡，是兽药第一要务，因此兽药不管危害，只要疗效；在当前，由于动物疫病依然复杂，兽药承担着既要防病促生长，又要控制药残和药费的任务，因此高效、低毒、低残留的兽药是发展方向；未来，随着动物传染病的减少，使用兽药治疗已发病的食品动物已失去意义，使用无毒、无药残的兽药成为发展方向。
今后，随着居民生活水平的提高，社会对畜产品安全的日益重视，减少畜产品中的疫病和药残问题，是未来的大趋势；国外对食品动物限制、禁止使用抗生素等兽药的政策势必影响我国。总起来说，兽药生产企业有四大发展趋势。
1.减少兽药生产企业数量，通过兼并联合，形成跨地域、专业化大企业集团，以提高效率。
2.化学药品中兽药可用品种减少，中兽药增多。按照人用药优先兽药发展的原则，兽药一方面只能协同人药发展，另一方面可以借助人用药的科研开发能力，发展兽用药品。
3.兽药品牌逐步树立，质量可靠、信誉良好的企业能够长久生存。制假售假的企业必将被法律和市场淘汰。兽药增值是有限的，兽医技术的附加值是无限的。兽药生产企业未来以畜牧兽医技术服务为主导，开展社会化、合同化服务承包，建立地区性垄断企业。
4.非食品动物用药，如宠物、皮毛等经济动物用药逐步得到重视。未来重大动物传染病得到有效控制后，奶牛、种用动物、生猪、宠物、观赏动物等经济价值高的动物，需要调节生理机能、防治内科疾病的药物。
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