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选择指数——基因组时代的可能性

作者:Dinesh Thekkoot来源:加裕种猪时间:2018-05-14 14:34点击:

选留是我们选择动物作为下一代的父母的过程,我们从驯养开始就一直这样做。重要的问题不是选择是否有经验的,而是选择的目标是什么。在今天的猪肉行业,目标是最大化利润。因此,确定最佳的动物或,利润最大化得动物是选留过程的关键部分。

传统的选留体系需要在不同的生命阶段和不同的环境/地点对许多猪的多性状进行亲源关系记录和性能测试。这个过程非常耗时,而且具有很大的经济影响。随着基因组技术和方法的进步,现在有可能克服许多这些限制。基因组应用提供了从更广泛的猪群中收集新的、更详细和复杂的信息/性状的机会。这和其他一些因素,如对动物生物学有更深的理解,发展新的传感/记录技术等,使我们能够定义和测量新性状,并提高选择指数中使用的当前性状。

这些新技术对当前指数性状最大的益处是:

健康和合适的性状:这是一个显著受益于先进的基因组和相关技术的领域。例如,PRRS和PED是影响全球养猪业的经济重大疾病。虽然疫苗接种和生物安全措施在控制疾病暴发方面发挥了重要作用,但病毒株的变异性和传染性阻碍了这些步骤的有效性。生产商还面临着来自消费者和监管机构的越来越大的压力,要求他们减少抗生素的使用,并提供更好的动物福利。这些因素伴随着降低生产力和增加劳动和兽医费用的成本增加,需要组织在选择指数中纳入健康性状。基因组改进提供了更有效的机会,将这些性状包含在选择指数中。加裕已经开始实施这一方法,并在选留过程中使用一种单核苷酸多态性(SNP)标记,与PRRS疾病的耐受性相关。

胴体和肉质性状:加裕致力于胴体和肉质的改良。自1998年以来,加裕已经进行了每周一次的胴体和肉质检测项目,并在选留过程中加入了这些性状。正因为如此,加裕种猪继续在胴体、肉类和食用品质方面表现出色。在选留计划中基因组学帮助我们以更有效率和更有效的方式改善这些性状。例如,对肉质性状(颜色、标记、pH值等)的估计育种价值(EBV)的准确性上平均增加了76%,而胴体性状(胴体背膘厚度、胴体腰肌和热胴体重量)则增加了137%。

采食性性状:加裕已经记录了多年的生猪生长期和母猪哺乳期的饲料采食量,并一直在选留计划中使用。再加上基因组学和自动记录技术使估计育种值的准确性提高了30%以上,从而提高了遗传改良速度。

生长和繁殖性状:我们的研究证实了包含基因组信息的EBV准确性的增加,表明了针对大约克、长白和杜洛克的生长性状的平均预测精度(120公斤日龄,背膘厚度和眼肌深度等)分别增加了47%、101%和60%。同样地,使用基因组学使大约克和长白群体总产仔数的EBV准确性增加了超过100%。这些准确性的提高转化为提高基因反应和加裕客户的盈利能力。

未来可以添加的新性状:

基因改良的重点必须是饲养在商品生产群体中的杂交猪。利用基因组学将有助于在商品群体中增加杂交动物的信息,以评估在一个核心群体中的纯种动物。目前,加裕正在与阿尔伯塔大学和爱荷华州立大学合作开展一项大型研究项目,以确定基因组技术在核心群体选留过程中纳入商品杂交信息的优势。最近一份关于肠道菌群的加裕技术报告概述了一项与猪疾病恢复力有关的项目,其中肠道微生物组也是一个组成部分。如果经济上很重要,这些特征将被纳入未来的选择指数。除了直接和间接测量的猪的性能,一组名为“组学数据”的新数据正在从功能生物学的研究中收集。例如,在不同的发育阶段、蛋白质结构、甲基化状态、调控元件的相互作用等方面,哪些基因表达在特定的组织中。所有这些数据都可以作为更好的预测因子,以识别出更好、更健壮的猪。加裕正在密切关注这些领域,并参与了在加拿大和美国的各个研究型大学中开展的许多研究项目。如果发现这些“特性”的经济性,他们将被纳入未来的日常选留计划中。

责任编辑:崔行之  

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